lilo를 사용하지 않고, slave의 윈도우만으로는 부팅이 되나요? 안될거 같은데...
제가 알기로 윈도우는 master에서 첫번째 os로 만 부팅 가능한걸루 아는데요.
 하드를 서로 바꿔서 해보시는게 좋을것 같네요. master를 slave로 slave를
master로...
 이럴 경우 fstab과 lilo.conf를 수정해주셔야 할것 같군요.