본래 첫번째 파티션에 윈도우즈를 까려고 공간을 비워두고,
두번째 파티션에 리눅스를 먼저 깔았죠.
그리고, 윈도우즈를 깔았는데, 부팅후 보니까 C가 아닌 F로 뜨더군요.
F:winnt  이렇게요.
그래서, f:bootsect.lnx 에 넣었던 건데,
 c:bootsect.lnx="linux"
 해보았더니, f드라이브에 있는 bootsect.lnx를 인식하여
리눅스로 부팅이 되더군요.
 즉, WINNT디렉토리가 있는 F:에 BOOTSECT.LNX 화일을 넣어 두고,
BOOT.INI 셋팅은 C:BOOTSECT.LNX="LINUX"로 셋팅합니다.
 와우리눅스 홈페이지에 글을 올려서 답변 받은거구여..
저같은 분이 있을까봐 해결책을 여기에 올립니다.