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통짜로 파티션을 잡았으면 어쩔 수 없구요. 글구 df -h로 용량을 봐서 뭐하다면 /var같은데 깔아도 되지않나 싶은데.. 해보지는 않아서 모르겠음. # ./configure?prefix=/var(남은 경로) 아니면 mysql의 data가  /usr에서 불필요한 패키지를 제거하고 공간확보를 한다음 data가(*.ism,*.frm등등)을 사용자별로 $HOME/data..홈으로 옮겨서 링크로 해결을 하면 어떨까요.

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