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[root@baby:/home/zoo11/src/py/work] cat data AAGCTTCTCGGTGGAGTCTTCTTCAGCTTCTGGGTCCTCGCGCATCTCTACCCCTTCGCCAAGGGCCTCA [root@baby:/home/zoo11/src/py/work] cat cu.sh #!/bin/sh b=1 while [ $b -le 6 ]; do cat data | cut -b $b- | fold -w 6 > $b.txt b=$((b+1)) done : 그러니까 이게 데이타 파일이죠. : 여기서 첫줄은 제외고 그다음 줄 부터예여. AAGCTT...부터여 : >gi|12039362|gb|AC018727.10|AC018727 Oryza sativa chromosome 10 BAC : AAGCTTCTCGGTGGAGTCTTCTTCAGCTTCTGGGTCCTCGCGCATCTCTACCCCTTCGCCAAGGGCCTCA : TGGGCAGGAGGGGAAGGACACCCACCATCGTCTACGTCTGGTCTGGCCTCGTCGCCATCACCATCTCCTT : GCTCTGGATTGCAATCAAGCCTCCTTCTGCACAAGCCAACTCACAGCTAGGAGGATCCTTCTCTTTCCCC : TGATATACATATATTCTCATTCCACACACCCAATCCAGACTACCTGTCTCTCTGCTATCTGCTTGCTTAG : GATTCATTCATATGCTAGCTGGTCGATCGAGCTACCGCAGCCTAGGGAACATGATCATATCACCCACAGT : ........ : : 그리구 이걸 이렇게 만들려구여.... : : 파일 1: : : AAGCTT : CTCGGT : GGAGTC : ...... : : 파일 2: : AGCTTC : TCGGTG : GAGTCT : TCTTCA : ...... : : 파일 3: : GCTTCT : CGGTGG : AGTCTT : ..... : : 파일 4: : CTTCTC : GGTGGA : ...... : : 파일 5: : TTCTCG : GTGGAG : ...... : : 파일 6: : TCTCGG : TGGAGT : ...... : : 이렇게 데이타 파일에서 둘째줄의 맨 앞에서 부터 한 글자씩 지워가면서 6개 : 글자 단위로 잘라서 6개의 파일을 만들려고 합니다. : : 밑은 아까 올렸던 질문입니다. : : >밑에 답변 주신 차주현님 감사합니다. : >근데 좀 문제가 있어서여.... : : >어제 드린 질문입니다. : : >>하하 밑에 답변 주신분 감사함다! : >>근데 하나만 더 갈켜주세여... : >>쉘 프로그램을 짜서 다음과 같은 작업을 하려고 합니다. : : >>"TCAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT" : : >>이런 문자열에서 맨 앞에 한글자씩 지우면서 각각의 파일을 만드는 방법이 : >>없을까여? 그러니까 : >>"CAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT" : >>"AACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT" : >>"ACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT" : >>"CTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT" : >>...... : >>이런 식으로여.... : : >근데 문제는 갈켜주신게 파이썬이라서여. : >쉘 스크립트 만으로 짜고 싶은데... 그건 좀 어려운가보져? : : >grep -v ">" $1 | tr -d "" | fold -w6 > $2 : : >바로 이 스크립트 중간에 넣고 싶어여. : : >그러니까 제 목적은 : >"TCAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT" : >이런거 하나 만들어서 6글자씩 잘라서 파일 하나 만들고 : >"CAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT" : >이런거 또 하나 만들어서 6글자씩 잘라서 또 파일 하나 만들고 : >..... : >이런 식으로 딱 6번 만 하고 싶어여. : : >갈켜주신 파이썬 스크립트는 파일 끝까지 다하니까 셀 수 없이 많은 파일이 : >만들어지는군여.... : >그러니까 제가 만들 스크립트의 tr -d "" 다음에 넣으면 될 거 같은데... : >한번만 더 봐주세여.... : : -- : 야 ! 봄이다! 아이 좋아....--return true
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