저와 같은 경험을 하셨군여.. 첨에 저도 어찌할지 몰라서 당황했는데...
 일단 리눅스 CD 를 넣으시고 부팅을 하세요..  설치를 하시다보면
 fdisk 화면이 나오시져??
 그럼 fdisk 로 들어가셔서.. 모든 파티션을 지우시고 write 하신후
 파워를 끄시고.. 도스 fdisk로 다시 파티션을 나누세요...
 그런후 윈도우 설치 하시면 됩니다..
 좀 무식한 방법인거 같아도 확실합니다...
 도스 fdisk 와 리눅스 fdisk 가 틀려서 리눅스 파티션을 도스
 fdisk로 삭제를 하실 수 없기때문에.. 리눅스 fdisk 로 지우셔야 합니다.
 도움이 되셨으면.. 이글을 읽으시고.. 제가 모자란 부분이 있으면
 답변이나 이메일 부탁 드립니다.. 감사합니다.