저도 이런 경험이 있습니다. 알짜 6.0부터선가는 보안상 까다로워졌다고 하던데요.
암튼 일반 계정사용자에게 cgi를 사용하게 할려면 님의 말대로 httpd.conf파일을
셋팅을 해야하는데,
아무리 해도 안되어서 그냥 cgiwrap이라는 프로그램을 얻어다 깔았더니 되더군요.
cgiwrap를 얻을 수 있는 곳은 기억이 나질 않는데 이 게시판에서 cgiwrap으로 찾아서
그 사이트에서 얻었던것 같습니다. 설치,구현,사용 설명까지 한국말로 잘 되어있더군요.
 도움이 되셨기를...
: server의 /service/myhome/cgi-bin/test.cgi를 브라우저에서 실행(이때
: URL : www.myhome.co.kr/cgi-bin/test.cgi)하면 실행이 됩니다.
: 그런데, 같은 server의 /home/gilnam/public_html/cgi-bin/test1.cgi를
: 브라우저에서 실행하면 다음과 같은 실행할 수 없습니다.
: "You don't have permission to access
:  /~gilnam/cgi-bin/test1.cgi on this server."
: 제생각에는 httpd.conf를 수정하면 가능할거 같은데, 정확이 어딘지를
: 모르겠습니다.
: 제발...
:
: --
: 김길남