xvidtune은 설정 프로그램이 아닙니다. 님이 수작업으로 계산한 Modeline값을 테스트할 때 쓰는 프로그램일 뿐입니다. Modeline은 설정파일에 직접 적어줘야 합니다. (Modeline 적을때 같은 해상도를 지닌 다른 Modeline 줄들에 대해서는 주석으로 막아버리는 것이 좋습니다. X서버가 그 해상도를 선택하도록 선택의 여지를 줄여버리는 것이죠.--Written by the Black Knight
Modeline 은 설정 파일에 직접 적어야 한다는 설명이 맞습니다. 같은 해상도의 줄은 필요 없으면 주석 처리해서 X 가 원하는 모드를 고르게 하세요.