.inputrc파일에 set meta-flag on set convert-meta off set output-meta on 이렇게 적어줘도 안되는군요. 홈페이지의 FAQ를 봐도 이렇게밖엔 안나와있고요 혹시 성공하신분 계시나요?
cygwin 의 한글 입력은 .inputrc 의 meta 설정으로 해결되지 않을 수 있습니다. 터미널 프로그램의 입력 인코딩을 EUC-KR 로 맞추고, 로케일을 ko_KR.eucKR 로 설정해 보세요.