/usr/local/mysql/var/ 디렉토리가 데이터 저장 디렉토리 인가 보군요.
mysql 서버는 따로 로그디렉토리를 지정해주지 않으면 위의 디렉토리를
기본 디렉토리로 사용합니다.
 mysql서버가 구동시 자신의 동작상태를 로그파일에 저장할려고 그러는데
아마도  /usr/local/mysql/var/ 디렉토리에 쓰기권한이 없는가 봅니다.
 mysql서버를 누구의 소유로 동작시키는지 확인해 보시고..
   또한
 /usr/local/mysql/var/ 의 퍼미션을 확인해서 수정하면 될 듯 합니다.
   : apm 설치하고 mysql연동되는가 확인도중에요
:
: [root@localhost bin]# touch: creating `/usr/local/mysql/var/localhost.localdomain.err': 그런 파일이나 디렉토
: 리가 없음 chown: getting attributes of `/usr/local/mysql/var/localhost.localdomain.err': 그런 파일이나 디
: 렉토리가 없음 Starting mysqld daemon with databases from /usr/local/mysql/var
: ./safe_mysqld: /usr/local/mysql/var/localhost.localdomain.err: 그런 파일이나 디렉토리가 없음
: ./safe_mysqld: /usr/local/mysql/var/localhost.localdomain.err: 그런 파일이나 디렉토리가 없음
: tee: /usr/local/mysql/var/localhost.localdomain.err: 그런 파일이나 디렉토리가 없음
: 020218 09:41:21  mysqld ended
: tee: /usr/local/mysql/var/localhost.localdomain.err: 그런 파일이나 디렉토리가 없음
:
: 이런 애러가 나네요...
: 어떻게 된건지?
:
: 참고로 아파치랑 php는 잘 작동되네요...