경험담이 아니라 질문에 더 가까운것 같습니다. 
 일단 정확히 부팅시 어디쯤에서 패닉이 나는지 알려주시지 않았기 때문에
irq 충돌이 아닐까 하는 정도의 추측을 할수 있구요.
 참고로 저는 마더보드는 abit kt7, 비디오 카드는 g200(agp), s3 virge(pci)
이렇게 둘을 쓰며 bios에서 agp 먼저 초기화하도록 되어 있습니다.
리눅스 Xfree 4.x 에선 당연히 되고 윈도그에서도 잘되더군요.
 <http://kltp.kldp.org/eunjea/xf86config4>
<http://kltp.kldp.org/eunjea/xinerama/>