db3 verify error 는 rpm 데이터베이스가 손상되었을 때 나오는 메시지입니다. rpm --rebuilddb 명령으로 데이터베이스를 다시 만들어 보세요. 그래도 안 되면 /var/lib/rpm 의 파일을 백업한 뒤 다시 시도하세요.