그러니까 이게 데이타 파일이죠.
여기서 첫줄은 제외고 그다음 줄 부터예여. AAGCTT...부터여
>gi|12039362|gb|AC018727.10|AC018727 Oryza sativa chromosome 10 BAC
AAGCTTCTCGGTGGAGTCTTCTTCAGCTTCTGGGTCCTCGCGCATCTCTACCCCTTCGCCAAGGGCCTCA
TGGGCAGGAGGGGAAGGACACCCACCATCGTCTACGTCTGGTCTGGCCTCGTCGCCATCACCATCTCCTT
GCTCTGGATTGCAATCAAGCCTCCTTCTGCACAAGCCAACTCACAGCTAGGAGGATCCTTCTCTTTCCCC
TGATATACATATATTCTCATTCCACACACCCAATCCAGACTACCTGTCTCTCTGCTATCTGCTTGCTTAG
GATTCATTCATATGCTAGCTGGTCGATCGAGCTACCGCAGCCTAGGGAACATGATCATATCACCCACAGT
........
그리구 이걸 이렇게 만들려구여....
파일 1:
AAGCTT
CTCGGT
GGAGTC
......
파일 2:
AGCTTC
TCGGTG
GAGTCT
TCTTCA
......
파일 3:
GCTTCT
CGGTGG
AGTCTT
.....
파일 4:
CTTCTC
GGTGGA
......
파일 5:
TTCTCG
GTGGAG
......
파일 6:
TCTCGG
TGGAGT
......
이렇게 데이타 파일에서 둘째줄의 맨 앞에서 부터 한 글자씩 지워가면서 6개
글자 단위로 잘라서 6개의 파일을 만들려고 합니다.
밑은 아까 올렸던 질문입니다.
>밑에 답변 주신 차주현님 감사합니다.
>근데 좀 문제가 있어서여....
>어제 드린 질문입니다.
>>하하 밑에 답변 주신분 감사함다!
>>근데 하나만 더 갈켜주세여...
>>쉘 프로그램을 짜서 다음과 같은 작업을 하려고 합니다.
>>"TCAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
>>이런 문자열에서 맨 앞에 한글자씩 지우면서 각각의 파일을 만드는 방법이
>>없을까여? 그러니까
>>"CAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
>>"AACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
>>"ACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
>>"CTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
>>......
>>이런 식으로여....
>근데 문제는 갈켜주신게 파이썬이라서여.
>쉘 스크립트 만으로 짜고 싶은데... 그건 좀 어려운가보져?
>grep -v ">" $1 | tr -d "" | fold -w6 > $2
>바로 이 스크립트 중간에 넣고 싶어여.
>그러니까 제 목적은
>"TCAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
>이런거 하나 만들어서 6글자씩 잘라서 파일 하나 만들고
>"CAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
>이런거 또 하나 만들어서 6글자씩 잘라서 또 파일 하나 만들고
>.....
>이런 식으로 딱 6번 만 하고 싶어여.
>갈켜주신 파이썬 스크립트는 파일 끝까지 다하니까 셀 수 없이 많은 파일이
>만들어지는군여....
>그러니까 제가 만들 스크립트의 tr -d "" 다음에 넣으면 될 거 같은데...
>한번만 더 봐주세여....
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야 ! 봄이다! 아이 좋아....