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RE: [질문]쉘 프로그래밍 하나만 더 갈켜주세여... 자
료여....

등록 2001-04-23 09:45:00     조회 2
이름 차주현    

[root@baby:/home/zoo11/src/py/work] cat data
AAGCTTCTCGGTGGAGTCTTCTTCAGCTTCTGGGTCCTCGCGCATCTCTACCCCTTCGCCAAGGGCCTCA
[root@baby:/home/zoo11/src/py/work] cat cu.sh
#!/bin/sh
 b=1
 while [ $b -le 6 ]; do
cat data | cut -b $b- | fold -w 6 > $b.txt
b=$((b+1))
done
  : 그러니까 이게 데이타 파일이죠.
: 여기서 첫줄은 제외고 그다음 줄 부터예여. AAGCTT...부터여
: >gi|12039362|gb|AC018727.10|AC018727 Oryza sativa chromosome 10 BAC
: AAGCTTCTCGGTGGAGTCTTCTTCAGCTTCTGGGTCCTCGCGCATCTCTACCCCTTCGCCAAGGGCCTCA
: TGGGCAGGAGGGGAAGGACACCCACCATCGTCTACGTCTGGTCTGGCCTCGTCGCCATCACCATCTCCTT
: GCTCTGGATTGCAATCAAGCCTCCTTCTGCACAAGCCAACTCACAGCTAGGAGGATCCTTCTCTTTCCCC
: TGATATACATATATTCTCATTCCACACACCCAATCCAGACTACCTGTCTCTCTGCTATCTGCTTGCTTAG
: GATTCATTCATATGCTAGCTGGTCGATCGAGCTACCGCAGCCTAGGGAACATGATCATATCACCCACAGT
: ........
:
: 그리구 이걸 이렇게 만들려구여....
:
: 파일 1:               
:
: AAGCTT                       
: CTCGGT                       
: GGAGTC
: ......
:
: 파일 2:
: AGCTTC
: TCGGTG
: GAGTCT
: TCTTCA
: ......
:
: 파일 3:
: GCTTCT
: CGGTGG
: AGTCTT
: .....
:
: 파일 4:
: CTTCTC
: GGTGGA
: ......
:
: 파일 5:
: TTCTCG
: GTGGAG
: ......
:
: 파일 6:
: TCTCGG
: TGGAGT
: ......
:
: 이렇게 데이타 파일에서 둘째줄의 맨 앞에서 부터 한 글자씩 지워가면서 6개
: 글자 단위로 잘라서 6개의 파일을 만들려고 합니다.
:
: 밑은 아까 올렸던 질문입니다.
:
: >밑에 답변 주신 차주현님 감사합니다.
: >근데 좀 문제가 있어서여....
:
: >어제 드린 질문입니다.
:
: >>하하 밑에 답변 주신분 감사함다!
: >>근데 하나만 더 갈켜주세여...
: >>쉘 프로그램을 짜서 다음과 같은 작업을 하려고 합니다.
:
: >>"TCAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
:
: >>이런 문자열에서 맨 앞에 한글자씩 지우면서 각각의 파일을 만드는 방법이
: >>없을까여? 그러니까
: >>"CAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
: >>"AACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
: >>"ACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
: >>"CTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
: >>......
: >>이런 식으로여....
:
: >근데 문제는 갈켜주신게 파이썬이라서여.
: >쉘 스크립트 만으로 짜고 싶은데... 그건 좀 어려운가보져?
:
: >grep -v ">" $1 | tr -d "" | fold -w6 > $2
:
: >바로 이 스크립트 중간에 넣고 싶어여.
:
: >그러니까 제 목적은
: >"TCAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
: >이런거 하나 만들어서 6글자씩 잘라서 파일 하나 만들고
: >"CAACTGAACTCATGCTTGCAAAGGTTGCTGGGATTGGTCCGGCAAAGAAATTGTAGGACAGAT"
: >이런거 또 하나 만들어서 6글자씩 잘라서 또 파일 하나 만들고
: >.....
: >이런 식으로 딱 6번 만 하고 싶어여.
:
: >갈켜주신 파이썬 스크립트는 파일 끝까지 다하니까 셀 수 없이 많은 파일이
: >만들어지는군여....
: >그러니까 제가 만들 스크립트의 tr -d "" 다음에 넣으면 될 거 같은데...
: >한번만 더 봐주세여....
:
: --
: 야 ! 봄이다! 아이 좋아....--return true
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